Обратите внимание, что в коде у вас только скрипт счетчика. А то, что вы хотите увидеть (прямоугольник с кол-вом посетителей) - это Яндекс Информер. Код информера должен выглядеть примерно так:
<!-- Yandex.Metrika informer -->
<a href="http://metrika.yandex.ru/stat/?id=0000000&from=informer" target="_blank" rel="nofollow"><img src="//bs.yandex.ru/informer000000/3_0_F5F5F5FF_F5F5F5FF_0_pageviews" style="width:88px; height:31px; border:0;" alt="Яндекс.Метрика" title="Яндекс.Метрика: данные за сегодня (просмотры, визиты и уникальные посетители)" onclick="try{Ya.Metrika.informer({i:this,id:7910290,type:0,lang:'ru'});return false}catch(e){}"></a>
<!-- /Yandex.Metrika informer -->
В метрике яндекса (там, где у вас список ваших сайтов) - вложенный файл.
Надо нажать на зеленую иконку "Редактировать счетчик", затем выбрать вкладку "Код счетчика" и откроется панель (вложение 2), где можно настроить информер и тут же будет приведен необходимый код, который нужно будет вставить в footer.tpl, заменив существующий код счетчика.
вот и все.