Разобрался и все получилось 8-) Вроде встали регионы как надо. Вобщем делал так:
1) Заходим PhpMyadmin, в базу данных с дефолтной темой сайта на Opencart. Открываем таблицу "Country", делаем экспорт этой таблице в файл Country.
2) Точно так же из таблицы Zone делаем экспорт только этой таблицы и сохраняем файл Zone.sql
Далее заходим в базу данных того сайта, куда вам необходимо сделать импорт стран и регионов:
Заходим в таблицу Country и удаляем в ней все, потом импортируем сохраненный нами файл country.sql
Так же далее заходим в таблицу zone и чистим ее, потом импортируем файл zone.sql
Главное делать именно в таком порядке, так как если сначало импорт zone делать, то потом регионы встают не в соответствии со странами.
Вобщем думаю это решение многим пригодиться, так как самому пришлось поломать голову, а прогуглив интернет решения не находил.