При настройке ЧПУ поддомен с магазином становится каталогом

[AlexMak]

В следствии этого ошибка 404 на основном сайте. 

В общем хочу привести в порядок ссылки, делаю всё по этой статье: http://jul-collection.com/opencart-nastraivaem-chpu-seo-pro-i-deadcow-seo.html 

Но при том, что ссылки принимают читаемый вид, поддомен (shop.mysite.ru) становится каталогом (mysite.ru/shop/) и из-за этого всё не работает. 

Как это сделать с умом? Я даже пока не могу понять на каком этапе настройки происходит это изменение

1. Замена seo_pro на модифицированный?

2. SQL запрос?

3. Что-то другое?

 

Прошу помочь мне разобраться. 

 

[AlexMak]

Куда-то делся весь мой текст. Итак, короче. Ссылки становятся не shop.mysite.ru, а mysite.ru/shop/ - из-за этого всё не работает. Как при настройке ЧПУ сохранить нормальный URL поддомену?