Что я выяснила...
Эти файлы системные, они самовоссоздаются после удаления. Но с гораздо меньшим размером.
.trash - это корзина. Очищать её лучше через панель управления хостинга (или менеджер файлов есть ещё такое название на хостинге). Через Файлзиллу оно как-то некорректо очищается и дольше.
В целом что я поняла - когда вы чего-то удаляете, например весь сайт, а потом загружаете на хостинг свой бэкап - ваш размер занимаемого пространства на хостинге растет, так как удалённое вами не удаляется, а переходит в папку .trash (в корзину). Исходя из этого нужно быть осмотрительней с удалениями и время от времени чистить через панель управления хостинга свою корзину.
Этот вывод естесно ИМХО, он основан на моих догадках и предположениях, полученных в результате проделанных сейчас экспериментов. Может кто знает тему лучше - плиз, просветите и будет вам щастя... (с огульными предложениями чтения инструкций и разных там справочников - катитесь лесом)