Порядок обновления

[ezet]

Всем привет. Решил обновиться с 1.5.3.1 до 1.5.4.1.

 Сделал следующее:

1- Залил из папки Upload всё кроме обоих файлов config.php и папки image

2- Выполнил обновление( успешно)

3- Сайт весь перекосило и я залил из старого архива папки: Theme, javascript и папку Module по пути catalog\controller

4-Сайт стал прежним и в файле index.php  версия стала 1.5.4

Вопрос назрел вот какой- Все вот эти манипуляции с папками (Theme, javascript ,Module) не могли повлиять на обновление? Просто я не знаю ещё, какие  основные файлы изменяются при обнове.

Благодарю за ответы.