Не прописывайте данную директиву в robots.txt!
+1
Да, можно сразу.
Вам не нужно беспокоиться, это не переезд работающего сайта, интернет-магазин делается с нуля.
Другое дело, когда требуется перенести уже существующий (работающий) сайт, например, смена cms, то, сперва новый делают на поддомене/используя технический домен, предоставленный хостинг провайдером, далее, делают чтобы интернет-магазин новый доступен был по основному домену. Это делается для того, чтобы работающий сайт не просел в поисковых системах/не пропало часть страниц, и был доступен для покупателей.
Так что, лично Вам, не нужно беспокоиться, ведь сайт с нуля делаете. Просто включить режим тех. обслуживания, и то, даже это совсем необязательно делать.
Если сами всё делать собираетесь, мало опыта, то делайте копию сайта, так сказать, черновой вариант сайта, чисто для тренировок. Потренировались, научились что-то там делать, и проделали то же самое на основном сайте, но уже без ошибок. Так что, да, рекомендую сделать и тестовый сайт. Можно и на локальном сервере (у себя на компьютере).