планируется не в ближайшее время точно пока что, есть более приоритетные задачи, сказать точно когда не могу на данный момент
разные методы оплаты там есть (в том числе и яндекс деньги и банковские карты)
отличие в том что яндекс касса это для ПРОДАВЦОВ ип или организаций, а другой модуль для обычных людей (ПРОДАВЦОВ) у которых есть кошелек
у яндекс кассы вы заключаете договор с яндекс кассой, а у другого модуля достаточно просто иметь кошелек
если вы получаете оплату от покупателей с банковских карт и эти деньги вам поступают на кошелек яндекс(никаких договоров, ип и ооо не нужно) то вам нужен модуль https://opencartforum.com/files/file/5421-yandeksdengi-i-bankovskie-karty-pro-dlya-fizicheskih-lic/ тут клоны есть и вы сможете сделать так как вы хотите оплата 100 и предоплата 50
а если вы получаете оплату с банковских карт с покупателей через яндекс кассу (вы заключили договор с яндекс кассой от своего ип или ооо) и они вам оплату присылают на расчетный счет , то нужен модуль https://opencartforum.com/files/file/4602-yandeks-kassa-pro-rasshirennyy-protokol/ тут клонов пока нет и вы сможете сделать только оплата 100 или предоплата 50