Сам сегодня столкнулся с такой задачей. Как оказалось, скрипт, добавляющий товар в корзину из категорий, по-умолчанию поддерживает добавление указанного количества товара. Нужно только добавить поле input с указанием id (например: id="quan_<?php echo $product['product_id']; ?>") и фильтром чисел (например: onkeyup = 'this.value=parseInt(this.value) | 0'). Затем добавить вторым аргументом в addToCart следующее: document.getElementById('quan_<?php echo $product['product_id']; ?>').value
После этого можно добавлять любое количество товара, оставаясь при этом в категории.
