если возможно, добавить проверку на значение таймаута PHP которое может привести к 504 Gateway Time-out,
разделить проверку на несколько порций или вывести совет/описание в блок "состояние сервера" что желательно сделать, чтобы ошибки не было.
при попытке открыть сканер ошибка 500
PHP Fatal error: Allowed memory size of 536870912 bytes exhausted (tried to allocate 20480 bytes) in /system/library/db/mysqli.php on line 31
удалось решить если в методе getScanResults модели box_antihack.php добавить limit. если возможно - добавить пагинацию и/или группировку по типу проблемы: superglobal_danger, preg_replace_eval, php_in_image и т.п.
установил лимит на 500, сканер нашел более 500 проблем, в основном php_in_image
мелкие правки верстки
при генерации .htaccess опечатка
# Requires: a]_enmod remoteip