Я правильно понял - вы хотите документы из 1с импортировать на сайт, чтобы на сайте создавать заказы? Зачем такие сложности?
Тут логика "двухстороннего" обмена должна быть иной мне кажется.
Если на сайте/сайтах оформляется заказ, то с сайте он должен экспортироваться в 1с, там этот товар должен списываться (уменьшаться остатки и товара и опции).
Если в 1с количество товара/опции изменяется (оффлайн продажа, продажа в другом магазине, поступление товата и т.д.) то на сайт импортируются изменения и у товаров/опций которые они затронули меняется к-во, цена и т.д. Причём достаточно именно изменить товары, а не "импортировать заказ со списанием опций и общего количества товаров".