Как вывести фильтры в родительских категориях?

Модуль работает только в тех категориях, где есть товары. Поэтому первым делом проверьте выводятся ли у вас товары в родительских категориях.

Если нет, то вы можете вывести их таким способом:

Откройте catalog/controller/product/category.php

найдите 

'filter_category_id' => $category_id,

после добавьте

'filter_sub_category' => true,

сохраните файл и обновите модификаторы в админке сайта.

Теперь вы можете включить вывод фильтров в родительских категориях активировав эту настройку модуля