Вариант 1:
1. Включить в админке SEO_URL без категорий
2. Прописать каждому товару SEO_URL
3. Закрыть индексацию всех дублей страниц (через категорию, через производителя)
Вариант 2:
1. Включить в админке SEO_URL с категориями
2. Прописать каждому товару SEO_URL
3. Прописать в .htaccess редирект со старых адресов на новые, после индексации страниц по новым адресам - почистить .htaccess
А какой у вас товарооборот, сколько этих банок было выпущено с кодами? И сколько человек, кроме вас, проверяло этот QR-код? Лично я не пользуюсь ими, хотя приложение считывания QR-кодов есть. Консервы покупают 90% женщины в возрасте, которые не то, что QR-коды не сверяют, а даже не знают, что это такое. Не обращайте внимания, делайте все по-уму, а потом по-уму перепечатаете этикетки.