Отличается много чем, смотрите описание и скришоты, основное:
Будет заказ сразу виден в админке, как только пользователь ушел на оплату.
Будет возможность оплаты в корзине в виджете.
Есть возможность холдить деньги до проверки наличия товара менеджером и списывать или возвращать клиенту не зачисляя себе на счет c админки магазина.
Есть возможность получить список всех платежей по датам и списать\вернуть деньги.
Есть возможность создать счет на оплату (инвойс) и дать клиенту сразу ссылку на оплату через удобный канал (смс, вайбер, почту и тд)
Инвойс создается на основе заказа или произвольно.
С помощью инвойса можно взять предоплату к заказу (при оплате например наложкой), генерируете инвойс с суммой нужной вам.
И прочие мелочи.
Это все есть в стандартном модуле?