на Главной странице Сайта нет товара - там не из чего фильтровать, и соответственно фильтру там нечего делать.
сделайте одну Главную/Основную страницу Категорий, к которой будут прикреплены под-категории с товарами, и тогда фильтр можно будет вывести на Главной Категории, даже если к ней не закреплены непосредственно товары (например, если товары закреплены в под-категориях).
еще один вариант может быть, - если Вы на Главной странице Сайта прикрепите GET-параметр категории, например path или filter_category_id , и соответственно выведете на ней товар, то тогда фильтр будет работать.
как вывести на Главной странице сайта товар - где-то в темах здесь на форуме уже рассматривалось.