Параметр manufacturer_id не используется, т.к. он предполагает использование только одного целочисленного значения. Вместо него модуль использует filter_ocfilter=m:21,43 , где 21 и 43 - это manufacturer_id. Отвечая на ваш вопрос, перехватить можно, используя разбор параметра GET filter_ocfilter.
В отключении тега есть смысл тогда, когда следующий выбор углубления будет иметь тег noindex, nofollow. Чтобы не плодить поисковиком лишние запросы на сервер, можно использовать onclick="location = ...".
Подумаю над правильной реализацией в последующих версиях.
Мобильная версия поддерживается. Если проверяете браузером, то после уменьшения окна нужно обновить страницу.
Можно ссылку на сайт? (можно в личку). Блок модуля в мобильной версией привзывается к классу .breadcrumb, возможно, что он переименован или скрыт.
Тег
<meta name="robots" content="noindex,nofollow" />
появляется на странице тогда, когда выбрано n-ое количество пересечений фильтра. Это количество можно указать в настройках модуля.
Каноклами модуль фильтра не будет заниматься. Для этого есть другие инструменты и руки программиста/SEO-оптимизатора.
Посадочные страницы нужны не для того, чтобы для каждого варианта пересечений создавать записи, а для выделения особо продвигаемых и необходимых запросов. Это исключения для автоматически создаваемых meta-данных.
И последнее, в будущем можно будет задавать meta-данные, маски, шаблоны, варианты вывода и прочее для каждого фильтра и его значений.
В настоящее время доступен тот вариант, который вы видите.