Это легко делается и сейчас, просто в system/library/url.php уберите блок для замены маршрута checkout/cart (первый блок после SIMPLE START)
Давно собираюсь фак сделать, но руки не дойдут
На письма не влияет, <br> дописывается к комментарию, который уходит в письме, причем пользователю уходит html версия с картинками (насчет картинок поднимался вопрос не раз, в том числе и в этой теме, надо проверять настройки клиента), а админу - текстовая, поэтому <br> и виден. В этой же теме странице на 75 давал разъяснение по поводу писем, что и как, в том числе и решение как отправить админу то же самое письмо (нужно заменить одну строчку кода). Повторюсь, что модуль это не затрагивает, письма отправляет сам опенкарт.
catalog/model/checkout/order.php
метод confirm()
найти
$mail->setTo($this->config->get('config_email'));
и добавить после этой строки
$mail->setHtml($html);