попробуйте у себя такой вариант:
- в файле admin/controller/sale/order.php приблизительно на 777 и 811 строчках найти $replace = array( и немного поменять строчки местами (например так)
'firstname' => $order_info['payment_firstname'],
'lastname' => $order_info['payment_lastname'],
'postcode' => $order_info['payment_postcode'],
'country' => $order_info['payment_country'],
'zone' => $order_info['payment_zone'],
'zone_code' => $order_info['payment_zone_code'],
'city' => $order_info['payment_city'],
'company' => $order_info['payment_company'],
'address_1' => $order_info['payment_address_1'],
'address_2' => $order_info['payment_address_2']- способ доставки в счет-фактуре, по-идее, должен быть указан при подсчете итоговой суммы (например в строчке перед НДС).