Первая ссылка выдана абсолютно правильно
Вторая ссылка имеет право на существование, но лучше закрыть страницы с постраничной навигацией
Disallow: /*?page=
Disallow: /*&page=
Третья ссылка образовалась из за наличия метки в увлажняющей сыворотке, в двух других сыворотках метки весьма странные... рекомендовал бы вообще закрыть страницу поиска
Disallow: /*route=product/search
Четвертая ссылка - закрывается так
Disallow: /*?sort=
Disallow: /*&sort=
Disallow: /*?order=
Disallow: /*&order=
Пятая ссылка - закрывается так
Disallow: /index.php?route=product/product*&manufacturer_id=
Disallow: /*?limit=
Disallow: /*&limit=
Шестая ссылка нормальная, но всё же лучше прикрутить дополнение для устранения дублей
Кроме этого у тебя наблюдаются проблемы с многобайтными кодировками (точнее с функциями которые не умеют с ними работать)
И разберись со скриптами jquery ui - на страницах по 4 ошибки 404 Not Found